Κατά την εκτέλεση του λογισμικού ερευνητικές ομάδες μαθητών, αποτελούμενες από τρία έως τέσσερα μέλη, επιλέγουν και δουλεύουν σε κάθε μία (ή και σε όλες) από τις τρεις θεματικές ενότητες του λογισμικού, ανάλογα με τις δυνατότητές τους. Κατά τη διάρκεια αυτού του χρόνου, οι μαθητές υποβάλλονται στην επιστημονική διαδικασία (προϋπάρχουσα έρευνα, συλλογή δεδομένων, εξαγωγή και ερμηνεία αποτελεσμάτων, δημοσιοποίηση των συμπερασμάτων τους), η οποία κινητοποιεί τους μαθητές να πάρουν μέρος ενεργητικά στη μάθηση. Η διαδικασία αυτή λαμβάνει χώρα στις αντίστοιχες οθόνες του λογισμικού, δηλαδή στις οθόνες : "Εργαστηρίου Φυσικής", "Βιβλιοθήκης", "Διαλέξεων", "Εντευκτηρίου". Το τελικό αποτέλεσμα όλης αυτής της εργασίας είναι η παρουσίασή της από τους μαθητές στην τάξη τους.